blastn (クエリ:塩基配列,検索対象:塩基配列)

Query

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Program

  • blastn

Data Sets

  • DDBJ/EMBL/GenBank 全配列データ (DDBJ定期リリース+新着データ)
  • 古典的区分の配列データ (DDBJ定期リリース+新着データ。 但し以下を除く; PAT,EST,STS,GSS,HTG,TSA）
  • DDBJ新着データ
  • PAT: 特許に登録された塩基配列データ
  • ENV: 環境上のサンプルに由来した配列
  • GSS: short single passのゲノム配列データ
  • HTC: EST以外のcDNA配列プロジェクトに由来する配列データ
  • HTG: ゲノムプロジェクトに由来する配列データ
  • STS: ゲノムシーケンシングのタグとなる配列データ
  • EST: Expressed sequence tag
  • TSA: 再構成された (assembled) mRNA 配列データ

    Optional Parameters

    SCORES
    ALIGNMENTS
    EXPECT
    FILTER ON OFF
    WORD SIZE